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Les scientifiques utilisent l’IA pour identifier les populations animales les plus susceptibles de diffuser des maladies aux humains

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Les poulets sont capables de transmettre la grippe oiseau à l’homme. (Geekwire Photograph / Lisa Stiffler)

La grippe aviaire, la maladie de vache folle, le hantavirus, la peste noire et d’autres maux notoires sont originaires des animaux et ont fait sauter aux humains.

Désormais, les scientifiques de la Washington State College ont construit un modèle d’apprentissage automatique pour examiner plusieurs indicateurs qui augmentent les probabilities d’une maladie qui sautait, y compris les caractéristiques écologiques des animaux hôtes, la génétique du virus et les animaux qui se chevauchent avec les humains.

Stephanie Seifert, Washington State College. (Photograph WSU)

L’équipe du École Paul G. Allen pour la santé mondiale du WSU College of Veterinary Medicine est axé sur une classe spécifique de maladies zoonotiques appelées orthopoxvirus – qui comprend les virus qui provoquent la variole et le mpox ou la variole de singe.

« Près des trois quarts des virus émergents qui infectent les humains proviennent des animaux »,  » Stéphanie Seifertun professional en émergence virale et en transmission des espèces croisées qui a aidé à mener la recherche, a déclaré dans un communiqué de presse. «Si nous pouvons mieux prédire quelles espèces présentent le plus grand risque, nous pouvons prendre des mesures proactives pour prévenir les pandémies.»

Des travaux antérieurs prédisant les orthopoxvirus potentiels se sont concentrés sur les traits animaux, notamment l’habitat et l’alimentation ainsi que sur la façon dont ils se sont comportés dans l’environnement. Les nouveaux travaux ont ajouté des informations essentielles sur la création génétique des virus.

« Notre modèle améliore la précision des prédictions de l’hôte et fournit une picture plus claire de la façon dont les virus peuvent se propager entre les espèces », a déclaré Pilar Fernandez, un écologiste de la maladie qui s’est associé à Seifert sur la recherche.

Pilar Fernandez, Washington State College. (Photograph WSU)

L’outil a mis en évidence des factors chauds potentiels pour les épidémies d’orthopoxvirus qui incluent l’Asie du Sud-Est, l’Afrique équatoriale et l’Amazonie – qui se croisent avec les populations humaines avec de faibles taux de vaccination pour la variole. Le modèle a souligné des espèces hôtes possibles telles que les rongeurs, les chats, les chiens et les espèces apparentées, les mouffettes, les belettes et les ratons laveurs – mais pas les rats, qui montrent que la recherche est résistante au MPOX.

Le modèle peut être ajusté pour rechercher d’autres sorts de maladies zoonotiques.

Les chercheurs ont publié une étude sur leur modèle dans la revue Biologie des communications. L’équipe comprenait des membres du Viral Emergence Analysis Institute qui sont situés à l’Université d’Oklahoma, à l’Université Collège de Londres et à l’Université de Yale.

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